長鏈非編碼RNA（lncRNA）是一類長度大于200nt的RNA分子，起初被認(rèn)為是基因組的轉(zhuǎn)錄“噪音”。近年來研究表明，lncRNA參與X染色體失活、干細(xì)胞干性的維持、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、表觀遺傳學(xué)調(diào)控等多種重要的生物過程。其中，lincRNA（基因間區(qū)lncRNA）是一類重要的lncRNA。豬是重要的家養(yǎng)動物和醫(yī)學(xué)大動物模型。然而，豬的lincRNA的注釋數(shù)量極少，以及l(fā)incRNA是否參與家養(yǎng)動物的馴化尚不清楚。
中國科學(xué)院昆明動物研究所張亞平院士課題組通過整合NCBI EST數(shù)據(jù)和已發(fā)表的RNA-seq數(shù)據(jù)，鑒定了4515個lincRNA基因（6621個lincRNA轉(zhuǎn)錄本）。通過分析家豬和野豬的大腦表達數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)30個lincRNA基因在家豬和野豬大腦表現(xiàn)為表達差異，可能與從野豬到家豬的馴化行為轉(zhuǎn)變有關(guān)，其中l(wèi)inc-sscg2561可能參與調(diào)控性情相關(guān)基因DNMT3A。該研究為豬的基因組學(xué)研究以及家養(yǎng)動物馴化的分子機制研究提供重要信息。
該研究結(jié)果(Genome-wide identification of long intergenic noncoding RNA genes and their potential association with domestication in pigs)已在Genome Biology and Evolution 發(fā)表。博士研究生周中銀為第一作者，張亞平院士和謝海兵博士為共同通訊作者。
該研究得到國家科技部項目、農(nóng)業(yè)部項目、自然科學(xué)基金委項目和云南省科技廳項目的資助。
