乙酰化(Acetylation)又稱乙;蛞阴;饔,是指將一個乙酰官能基團加入到一個有機化合物中的化學反應。在生命體中,蛋白質乙酰化作為一種非常重要的蛋白質翻譯后修飾存在,它調控著細胞凋亡、DNA-蛋白質相互作用、DNA復制和修復、DNA轉錄活性及蛋白質穩(wěn)定性等多種重要的生命過程。
中國科學院天津工業(yè)生物技術研究所宋江寧研究員帶領的結構生物信息學與整合系統(tǒng)生物學研究組與中國農業(yè)大學生物信息學中心及澳大利亞蒙納士大學醫(yī)學院和信息技術學院的科研人員合作,對蛋白質乙;_展了一系列深入研究。該工作開發(fā)出新的生物信息學工具SSPKA(http://www.structbioinfor.org/Lab/SSPKA/),用以精確識別基于物種特異性的蛋白質乙;稽c。這一研究通過構建物種特異性高精度的蛋白質乙;瘮(shù)據(jù)集、提取各類有效特征,并結合高效的特征選擇方法,建立了高準確率的隨機森林機器學習模型預測蛋白質乙酰化,并針對不同物種的乙;稽c預測模型開發(fā)了網(wǎng)絡在線預測工具和本地預測工具,繼而對人類蛋白質組進行了預測。這一生物信息學工具的成功開發(fā),對于蛋白質乙酰化位點的序列—結構—功能關系的深入研究具有重要意義。
該研究得到中國科學院百人計劃、知識創(chuàng)新工程項目(KSCX2-EW-G-8)以及國家自然科學基金(61202167, 61303169, 11250110508)的資助。最新研究結果發(fā)表在國際開放獲取期刊Scientific Reports上,天津工生所碩士研究生李元為論文第一作者。
