家豬毛色表型常作為易察覺的外型特征,在品種選育中起重要作用。六白(四蹄、頭和尾尖白色)是一種家豬中常見的毛色類型,在不同的歐亞家豬品種中均有發(fā)現(xiàn)。前人的研究揭示歐洲家豬出現(xiàn)的六白毛色與MC1R基因的插入突變緊密相關(guān),但對有著不同馴化起源的中國家豬來說,這一表型的形成機制至今并不清楚。在滇南小耳豬中,六白毛色占有很高比例,并且大量個體出現(xiàn)了不完全六白的特征,給該家豬品種的選育過程帶來了困難。
為了解決這一科學(xué)問題,中國科學(xué)院昆明動物研究所分子進化與基因組多樣性研究課題組利用二代測序技術(shù),對17頭具有六白毛色表型和14頭全黑表型的滇南小耳豬進行了全基因組測序;利用比較基因組學(xué)的分析手段,并結(jié)合大規(guī)模群體基因分型驗證,從分子層面上揭示了調(diào)控滇南小耳豬六白毛色的遺傳機制。研究結(jié)果顯示,滇南小耳豬的六白毛色并非由于MC1R基因的突變導(dǎo)致,而是受到多個基因共同調(diào)控的復(fù)雜性狀;CNTLN、PINK1和EDNRB三個基因組的變異共同解釋了滇南小耳豬群體中約20%的毛色表型變異;在六白個體中,EDNRB基因上有一段跨物種保守的CEBPB識別motif發(fā)生突變,可能導(dǎo)致了基因表達的改變。該研究拓展了對家豬馴化過程中毛色變異調(diào)控機制的認識,并且對滇南小耳豬的選育具有重要指導(dǎo)意義。
目前該研究成果已發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊Scientific Reports上,昆明動物所博士研究生呂夢蝶和韓徐曼為共同第一作者,張亞平和謝海兵為共同通訊作者。
該項研究工作得到了國家自然科學(xué)基金面上項目、科技部“973”計劃等項目的支持。
