6月1日，由中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)研究所李亦學(xué)研究組、美國密歇根大學(xué)醫(yī)學(xué)中心和日本山梨大學(xué)分子病理系等單位研究人員合作完成的論文“Hyperlipidemia-associated gene variations and expression patterns revealed by whole-genome and transcriptome sequencing of rabbit models”在線發(fā)表于Scientific Reports 雜志。這項(xiàng)工作通過高通量測序，首次系統(tǒng)揭示了高脂血癥和動脈粥樣硬化家兔模型在基因組和轉(zhuǎn)錄組上的獨(dú)特特征。

　　家兔是生物醫(yī)學(xué)研究中的一種重要模式生物。相比于大小鼠，家兔的脂代謝特征與人類更加接近。研究人員對三種最常用的實(shí)驗(yàn)家兔品系，包括新西蘭白兔（NZW）、日本白兔（JW）和渡邊可遺傳性高脂血癥家兔（WHHL）進(jìn)行了全基因組測序。群體遺傳分析表明WHHL的遺傳多樣性最低，但卻積累了最高比例的高頻有害突變。除了已知的LDLR缺陷以外，其他一些高頻有害突變可能也與WHHL的病理表型相關(guān)。研究人員同時(shí)對WHHL和高膽固醇飲食喂養(yǎng)的NZW中的相關(guān)組織開展了轉(zhuǎn)錄組測序。比較發(fā)現(xiàn)，這兩種家兔模型雖然高膽固醇血癥的類型不同，但主動脈病變卻顯示了類似的表達(dá)譜。然而，肝臟的表達(dá)譜僅在高膽固醇喂養(yǎng)的NZW，而不在WHHL中顯示出炎癥反應(yīng)和異常的脂代謝。這些結(jié)果為合理選擇家兔模型提供了重要依據(jù)，同時(shí)也為脂代謝和相關(guān)心血管疾病的分子機(jī)制研究提供了新的啟示。

　　這項(xiàng)工作在李亦學(xué)的指導(dǎo)和協(xié)調(diào)下完成，得到了科技部、國家自然科學(xué)基金委、中國科學(xué)院、美國國立衛(wèi)生研究院等項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)的支持。

WHHL中高頻有害突變篩選

WHHL和高膽固醇飲食NZW的表達(dá)譜比較