小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是細菌重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子,廣泛參與調(diào)控細菌各方面的功能。由于不同sRNA調(diào)控的靶標及其調(diào)控機制不相同,多數(shù)已鑒定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的調(diào)控靶標及調(diào)控機制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物調(diào)控型RNA研究的熱點。
近期,中國科學院武漢病毒研究所研究員陳士云帶領的病原細菌學科組在sRNA功能及調(diào)控機制研究方面取得進展。該研究以臨床重要的機會致病菌——銅綠假單胞菌為對象,通過生物信息學等方法鑒定出依賴于細菌壓力耐受因子RpoS的sRNA—RgsA的2個調(diào)控靶標:;D(zhuǎn)運蛋白AcpP及全局性調(diào)控蛋白Fis;在伴侶蛋白Hfq的輔助下,RgsA通過不完全互補配對方式調(diào)控這2個靶標的表達。進一步研究發(fā)現(xiàn),fis mRNA有兩個起始密碼子,且均受到RgsA的調(diào)控,并找到了調(diào)控的關鍵區(qū)域。RgsA還通過抑制細菌生長、運動性及促進毒素的分泌,參與調(diào)控細菌的毒力及生長等表型。該研究首次將全局性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子Fis與壓力相關因子RpoS通過sRNA的調(diào)控聯(lián)系起來,揭示了細菌在應對外界環(huán)境信號及壓力條件時,RgsA反饋調(diào)控AcpP和Fis這2個靶標的具體機制。
該研究由助理研究員盧培等人完成,論文在線發(fā)表在《分子微生物學》(Molecular Microbiology)。該研究得到國家自然科學基金青年基金項目(#31300124)的資助。

RgsA 通過反義互補配對直接調(diào)控fis及acpP表達
