λ-噬菌體作為一種被廣泛研究的有機(jī)體,已經(jīng)成為研究基因調(diào)控的最簡(jiǎn)單模式菌株。無(wú)論是基因表達(dá)的集中研究還是現(xiàn)代矩陣雜交技術(shù)的應(yīng)用,都闡明了λ-噬菌體在生長(zhǎng)過(guò)程中基因功能的復(fù)雜性。最近興起了一種核糖體圖譜新技術(shù),通過(guò)捕捉細(xì)胞內(nèi)核糖體的瞬間翻譯位點(diǎn)來(lái)為大家提供更細(xì)致和精準(zhǔn)的基因表達(dá)圖譜。
近日,中科院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所江會(huì)鋒研究組運(yùn)用核糖體圖譜技術(shù)獲得了λ-噬菌體基因表達(dá)的高分辨率圖譜。該研究將核糖體圖譜技術(shù)應(yīng)用于λ-噬菌體的溶菌生長(zhǎng)過(guò)程中,以獲得λ-噬菌體蛋白表達(dá)圖譜,從而來(lái)推斷翻譯的單一位點(diǎn)。
通過(guò)試驗(yàn),研究組驗(yàn)證了已知的基因表達(dá)過(guò)程,但是發(fā)現(xiàn)還有很多復(fù)雜的翻譯過(guò)程是不可預(yù)料的,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)很多核糖體都存在于未知功能的開(kāi)放閱讀框(ORFs)中;此外,核糖體連接在一起后可以改變mRNA翻譯其他信息的結(jié)構(gòu)及有效性。研究認(rèn)為,即便沒(méi)有功能性多肽產(chǎn)生,功能性O(shè)RFs也可能在轉(zhuǎn)錄開(kāi)始時(shí)被保留于基因組,因此,可以推斷所有這些ORFs的一部分根本沒(méi)有功能,呈現(xiàn)出的只是轉(zhuǎn)錄和翻譯系統(tǒng)的基本活性。
研究成果發(fā)表于PNAS期刊上。江會(huì)鋒為本文的共同第一作者,Jeffrey W. Roberts教授是通訊作者。
