真骨魚類是指輻鰭魚類中除去軟骨硬鱗魚類（多鰭魚，鱘魚）和全骨魚類（雀鱔，弓鰭魚）以外的其他魚類，它包括絕大多數(shù)現(xiàn)生魚類。真骨魚類是最為繁盛的脊椎動物類群，據(jù)《世界魚類》的記載，現(xiàn)生的真骨魚類大約有26840種，是全部魚類數(shù)目的96%，接近所有脊椎動物總量的一半。

    是什么原因?qū)е铝苏婀囚~類如此大量的適應(yīng)性輻射？其適應(yīng)性進(jìn)化的基因組學(xué)基礎(chǔ)是什么？為了探討上述問題，在中國科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員的指導(dǎo)下，博士研究生楊連東等通過比較基因組學(xué)及生物信息學(xué)的方法，從譜系特異基因的角度對真骨魚類的適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制進(jìn)行了系統(tǒng)性分析。研究人員首先利用BLAST比對軟件鑒定得到了兩組基因：真骨魚類譜系特異基因（135個(gè)）和斑馬魚物種特異基因（66個(gè)）。與進(jìn)化上保守的基因相比，譜系特異基因有如下特征：序列長度短，外顯子數(shù)目少，GC含量高，并且表達(dá)數(shù)目少。另外譜系特異基因在斑馬魚的基因組上染色體分布是不均勻的。起源分析顯示基因復(fù)制產(chǎn)生了大部分的譜系特異基因。時(shí)空表達(dá)譜分析表明：1）譜系特異基因更傾向于在大腦及性腺中表達(dá)；2）更傾向于在胚胎發(fā)育晚期及幼魚早期階段高表達(dá)。功能聚類分析的結(jié)果表明，真骨魚類譜系特異基因顯著富集于跟免疫反應(yīng)相關(guān)的功能中。

    該研究為進(jìn)一步揭示真骨魚類適應(yīng)性輻射進(jìn)化的分子機(jī)制提供了重要的參考價(jià)值。目前，該研究成果已經(jīng)在線發(fā)表在BMC genomics雜志。