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上海光源用戶揭示人源葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白GLUT1的結(jié)構(gòu)及工作機(jī)理

 5月18日,清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授顏寧研究組在Nature在線發(fā)表了題為Crystal structure of the human glucose transporter GLUT1 的研究論文,在世界上首次報道了人源葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白GLUT1的晶體結(jié)構(gòu),初步揭示其工作機(jī)制以及相關(guān)疾病的致病機(jī)理。

  葡萄糖(D-glucose)是地球上包括從細(xì)菌到人類各種生物已知最重要、最基本的能量來源。葡萄糖代謝的第一步就是進(jìn)入細(xì)胞:親水的葡萄糖不能自由穿透疏水的細(xì)胞膜,其進(jìn)出細(xì)胞需要通過鑲嵌于細(xì)胞膜上的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白完成。其中一類屬于主要協(xié)同轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白超家族(Major Facilitator Superfamily,簡稱MFS)的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是大腦、神經(jīng)系統(tǒng)、肌肉、紅細(xì)胞等組織器官中最重要的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(glucose transporters,簡稱GLUTs)。在人體的14個GLUTs中,GLUT1、2、3、4這四種蛋白生理功能最重要,研究最廣泛,其中GLUT1因發(fā)現(xiàn)最早而得名。

  GLUT1幾乎存在于人體每一個細(xì)胞中,是紅細(xì)胞和血腦屏障等上皮細(xì)胞的主要葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,對于維持血糖濃度的穩(wěn)定和大腦供能起關(guān)鍵作用。在已知的人類遺傳疾病中,導(dǎo)致GLUT1功能異常的突變會影響葡萄糖的正常吸收,導(dǎo)致大腦萎縮、智力低下、發(fā)育遲緩、癲癇等一系列疾病。另一方面,當(dāng)發(fā)生癌變時,葡萄糖是腫瘤細(xì)胞最主要的能量來源,但是腫瘤細(xì)胞由于缺乏氧氣供應(yīng)而只能對葡萄糖進(jìn)行無氧代謝,同質(zhì)量葡萄糖所提供的能量不到正常細(xì)胞的10%,因而對葡萄糖的需求劇增,在很多種類的腫瘤細(xì)胞中都觀察到GLUT1的超量表達(dá),以大量攝入葡萄糖維持腫瘤細(xì)胞的生長擴(kuò)增,這使得GLUT1的表達(dá)量可能作為檢測癌變的一個指標(biāo)。

  自從獲得了大量生理、病理、細(xì)胞、生化信息之后,獲取GLUT1的三維結(jié)構(gòu)就變成了該領(lǐng)域最期待的下一個突破。顏寧研究組在2012年首次解析了GLUTs的大腸桿菌同源蛋白XylE與葡萄糖結(jié)合的高分辨率晶體結(jié)構(gòu),并利用同源建模預(yù)測了GLUT1-4的三維結(jié)構(gòu);時至今日,人源GLUT1蛋白的晶體結(jié)構(gòu)的捕獲為理解這個具有歷史研究意義的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白掀開了新的一章。

  利用上海光源生物大分子晶體學(xué)線站(BL17U1),顏寧研究組最終解析了GLUT1的三維晶體結(jié)構(gòu)。GLUT1呈現(xiàn)經(jīng)典的MFS家族折疊方式——12個跨膜螺旋組成N端和C端兩個結(jié)構(gòu)域。兩個結(jié)構(gòu)域之間的腔孔朝向胞內(nèi)區(qū),即該結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)向內(nèi)開放構(gòu)象。而在結(jié)晶中用到的去污劑頭部恰好是葡萄糖苷,其結(jié)合位點(diǎn)與此前XylE中觀測到的葡萄糖結(jié)合位點(diǎn)基本重合,證實(shí)了MFS家族具有單一結(jié)合位點(diǎn)。有趣的是,GLUT1在胞內(nèi)可溶區(qū)還具有一個由4個α螺旋組成的結(jié)構(gòu)域(簡稱ICH),這一序列只在MFS中的糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白亞家族中(Sugar Porter subfamily)觀察到,因此ICH是屬于該家族蛋白的特有結(jié)構(gòu)特征。

  利用GLUT1的晶體結(jié)構(gòu)可以精確地定位與疾病相關(guān)的突變氨基酸,揭示其致病機(jī)理。分析顯示,三十余個突變氨基酸基本集中于三個區(qū)域:底物結(jié)合區(qū)域、胞外門控區(qū)、胞內(nèi)門控區(qū),它們的突變或者影響了底物識別,或者影響轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的構(gòu)象變化。晶體結(jié)構(gòu)使得理解這些致病突變的機(jī)理一目了然。與之前獲得的向胞外半開口的XylE晶體結(jié)構(gòu)比較揭示出 ICH在GLUT1的構(gòu)象變化中起關(guān)鍵作用。鑒于ICH在糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白亞家族的保守性,這一發(fā)現(xiàn)可能適用于該亞家族所有成員。 

  至此,顏寧實(shí)驗(yàn)室分別捕獲了FucP向胞外開放、XylE結(jié)合底物半開放、GLUT1向胞內(nèi)開放的三個MFS家族最具有代表性的轉(zhuǎn)運(yùn)狀態(tài)結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)比對初步揭示出MFS糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在轉(zhuǎn)運(yùn)循環(huán)中的構(gòu)象變化,對于理解MFS家族糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)過程提供了重要的分子基礎(chǔ)。

人源GLUT1的三維晶體結(jié)構(gòu)